1978年研究人员从美国实验室储存的血清中查到艾滋病毒抗体，但从1972—1973年在乌干达采集的血清也可以查到艾滋病毒抗体。从这些回顾性血清学调查的结果看来，首次感染艾滋病毒的人是在非洲。
艾滋病毒有HIV-1和HIV-2两个型。早已知道，HIV-2与从非洲白眉猴（sooty mangabey）、猕猴（Rhesus macaque）和非洲绿猴等分离的猴免疫缺陷病毒SIVsm、SIVmac和SIVagm等较相近似。这些猴是SIV的存储宿主。HIV-2与SIVsm的基因序列的同源性为70%，而与HIV-1的同源性仅40%左右。猴免疫缺陷病毒感染的猴血清能与HIV-2的糖蛋白（gp120和gp36）和壳蛋白P24等发生免疫反应，能与HIV-1的壳蛋白P24等起反应，但不与HIV-1的糖蛋白（gp120和gp41）起免疫反应。因此认为HIV-2型病毒是来源于SIVsm。但关于HIV-1的来源问题，长期未得到解决。
文献报道，从猩猩（pan troglodytes）中也分离到3株SIVcpz病毒，它与HIV-1病毒有关。研究人员是在加蓬捕捉到的猩猩身上分离到的2株病毒SIVcpzGAB1和SIVcpz GAB2，以及从赞比亚进口到比利时的猩猩身上分离到的病毒SIVcpzANT。其中SIVcpzGAB1和SIVcpzANT已经完成全核酸序列的分析。
美国阿拉巴马大学的高峰等发现了一只非洲进口的猩猩，它是98只猩猩中唯一的一只。应用免疫酶联法及蛋白印迹法检测，它的血清能与HIV-1抗原起很强的反应。此动物从未用作艾滋病毒有关的研究，也未接受过人的血清，1985年因怀孕生产后死亡，时为26岁。尸检发现有子宫内膜炎、存留胎盘和毒血症。用核酸扩增技术（PCR）对脾脏和淋巴组织作gag、pol的DNA序列扩增，显示其与HIV-1和SIVcpz有关，但有些差异。从组织中发现有vpu基因，目前仅HIV-1和SIVcpz病毒有此基因，而HIV-2和SIVsm病毒没有。他们将此病毒的基因命名为SIVcpzUS，它与已知的SIVcpz和HIV-1有关，但有差别。他们还发现HIV-1 N组的病毒核酸序列是SIVcpzUS和HIV-1有关核酸序列的杂交而成。因此认为猩猩的祖先就有病毒的重组。
根据下列证据认为HIV是从动物传到人的：
（1）病毒的基因组结构是相似的；
（2）基因系统树相关；
（3）在自然宿主中流行；
（4）地理分布一致；
（5）有合理的传播途径。
例如，在白眉猴中发现的SIVsm在系统树上与HIV-2很相似，而且其产地与HIV-2的流行区也一致。人和猴接触很密切，因为人常猎猴作为食物或作为宠物。HIV-1与SIVcpz在序列和基因组结构上很相似，虽然有些差异，但根据这些结果，认为猩猩（pan troglodytes）是HIV-1的原始存储宿主，也是SIVcpz传入人类的来源。
